本品属三苯甲烷类染料消毒剂，能与微生物酶系统发生氢离子的竞争性对抗，使酶成为无活性的氧化状态，而发挥杀菌作用。主要对革兰阳性菌如葡萄球菌、白喉杆菌，以及绿脓杆菌、白念珠菌、表皮癣菌有杀灭作用，对其它革兰阴性菌和抗酸杆菌几乎无作用。本品毒性小，对组织无刺激，且能与坏死组织凝结成保护膜，起收敛作用。有实验报告表明动物全身性(或系统性)吸收甲紫可致癌，有的国家规定本品只能用于局部未破损皮肤，严禁内服。但目前国内尚未见有关甲紫致癌的不良反应监测报告。

甲紫溶液遇酸呈绿黄色，遇碱游离出甲紫盐基的褐色沉淀。

对粘膜可能有刺激或引起接触性皮炎。

面部有溃疡性损害时应慎用，不然可造成皮肤着色。治疗鹅口疮时，只在患处涂药，如将溶液咽下可造成食管炎、喉头炎。涂药后不宜加封包。大面积破损皮肤不宜使用。本品不宜长期使用。