新霉素全身给药后在小肠的pH值环境下以高极性的高价离子形式存在,水溶性大,脂溶性小。口服后在胃肠道吸收很少,完整的肠黏膜只能吸收约3%,但有溃疡、表皮剥落或有炎症的黏膜可吸收相当药量。局部外用时,完整皮肤很少吸收,但烧伤创面、肉芽组织和表面剥脱的巨大创面则很容易吸收。药物吸收后主要分布于细胞外液,正常婴儿脑脊液中浓度可达血药浓度的10%v20%,当脑膜有炎症时,脑脊液血药浓度可达50%。本药在支气管分泌物、胆汁及房水中的浓度较低,胸腔积液内药物蓄积缓慢,但可逐渐达到与血液浓度相近。本药半衰期为2v4h,肾功能损害者可延长至27v80h。药物在体内不代谢,未被吸收的药物以原形由粪便排出,吸收的药物全部以原形经肾小球滤过,随尿液排出。给药4h内排出量约为50%,24h内排出量达80%v90%。