本品在临床主要用于艾滋病病毒感染所致的获得性免疫缺陷综合征。据报道齐多夫定在治疗艾滋病和相关综合征上有确切的疗效,如与去羟肌苷、拉米夫定联合应用,在减慢AIDS病程上和延长存活期上较单独应用更为有效。国外在一项双盲、对照临床试验中,144例患者(其中艾滋病者85例,T4淋巴细胞数在200/mm3以下的艾滋病综合征59例)口服本品,每次300mg,每天5次,对照组137例口服安慰剂。结果治疗组患者的死亡率比安慰剂对照组明显减少,生存期分别延长13.5和19倍。日本对12例艾滋病患者采用半量即每天0.6g治疗,约经2个月后,患者体重均增加10kg,贫血和胃肠道障碍症状消失。与此同时,美国艾滋病临床试验小组亦对每天1.5g与0.6g的本品治疗结果进行比较,认定两种药量治疗效果相同,但不良反应则0.6g组少。